История развития профсоюзной организации студентов ОмГУПСа неразрывно связана с историей университета. В советский период вопросами внеучебной деятельности и воспитательной работы занималась комсомольская организация. Также работала профсоюзная организация студентов. После переезда в Омск первым освобожденным председателем профсоюзного комитета студентов ОмИИТа с 1969 по 1972 год был Степан Петрович Андросюк — кандидат технических наук, доцент, который по настоящее время продолжает трудиться в университете на кафедре «Прикладная математика и механика».
В разные годы профком возглавляли:
Андросюк Степан Петрович — 1969–1972 гг.
Сергеев Борис Борисович — 1972–1973 гг.
Суворов Анатолий Николаевич — 1973–1975 гг.
Якименко Олег Ильич — 1975–1976 гг.
Семенов Алексей Иванович — 1976–1978 гг.
Гартман Владимир Генрихович — 1978–1983 гг.
Рой Вадим Владимирович — 1983–1985 гг.
Викулов Леонид Алексеевич — 1985–1986 гг.
Мусаткина Бэла Владимировна — 1986–1989 гг.
Парпура Андрей Викторович — 1989–2000 гг.
Искаков Зуфар Фаридович — 2000–2011 гг.
Солодянкин Юрий Владимирович — 2011–2013 гг.
Кабаков Антон Фёдорович — 2013–2016 гг.
Терёхин Илья Александрович — 2016–2019 гг.
Ринг Иван Сергеевич — с 2019–2023 гг.
Илюхин Никита Николаевич — с 2023 по настоящее время.
Во времена работы Степана Петровича Андросюка направления деятельности профкома были следующими: организационный, учебный, культурно-массовый, спортивный сектора, а также сектор общественного питания. Культурно-спортивная жизнь в институте всегда была интересной. Работали драматический кружок, вокальная группа, театр миниатюр, спортклуб и многое другое. Подготовка спортивно-оздоровительного лагеря в Чернолучье, распределение путёвок, контроль питания, организация агитпоездов также были в ведении профсоюзной организации, как и подготовка всех вечеров отдыха. Вся студенческая жизнь университета была организована именно через профсоюзный комитет студентов.
В эпоху перемен, когда комсомольская организация прекратила своё существование, а круг вопросов, касающихся студенчества, существенно расширился, профсоюзным комитетом студентов руководил Андрей Викторович Парпура (с 1989 по 2000 гг.).
Именно в эти годы происходило становление системы студенческого самоуправления: начали возрождать свою работу студенческие советы общежитий, был сформирован первый в городе студенческий отряд охраны правопорядка, проведен первый выездной обучающий семинар профсоюзного актива «Перспектива». Особой благодарности за работу на благо профсоюзной организации заслуживают Татьяна Евстафьевна Кордюкова, которая 42 года была бухгалтером профкома, и Татарникова Ольга Николаевна, занимающая эту же должность уже более 20 лет.
Первичная профсоюзная организация студентов ОмГУПСа входит в состав одного из крупнейших профсоюзов — Российского профсоюза железнодорожников и транспортных строителей (РОСПРОФЖЕЛ). 29 апреля 2010 года на конференции, посвященной празднованию 105-летия Российского профсоюза железнодорожников и транспортных строителей и 110-летию ОмГУПСа, было подписано коллективное соглашение между администрацией университета и первичной профсоюзной организацией РОСПРОФЖЕЛ студентов ОмГУПСа о сотрудничестве и взаимодействии в сфере учебной и воспитательной работы.
С 14 мая 2011 года начал работать центр по привлечению волонтеров для участия в организации и проведении XXII Олимпийских и XI Паралимпийских зимних Игр в Сочи в 2014 году. Это право было получено 7 декабря 2010 года на оглашении итогов конкурса «Волонтерские центры России». Наряду с ОмГУПСом, подобные центры открылись в 26 учебных заведениях страны.
Сегодня ППОС ОмГУПСа — это настоящий центр притяжения для молодежи. На 2024 год в организации успешно функционирует 21 направление, благодаря чему каждый сможет найти занятие по душе.